menu
arrow_back

Google Genomics : Qwik Start

Open Google Console

Caution: When you are in the console, do not deviate from the lab instructions. Doing so may cause your account to be blocked. Learn more.

Google Genomics : Qwik Start

30 Minutes Free

GSP143

Google Cloud – Ateliers adaptés au rythme de chacun

Présentation

Google Genomics permet à la communauté scientifique d'organiser les informations génomiques à l'échelle mondiale dans le but de les rendre accessibles et utiles à tous. Les avancées dans le big data et le machine learning ont ouvert la voie à un nouveau domaine : le "big data génomique". Des pétaoctets de ces séquences biologiques (qui atteindront très prochainement l'exaoctet) sont utilisés pour résoudre certains des problèmes les plus difficiles du domaine biomédical. Google Genomics est une API intégrée à Google Cloud Platform qui permet de stocker, traiter, explorer et partager très facilement de grands ensembles de données génomiques.

Dans cet atelier, vous allez utiliser Google Genomics pour mettre en œuvre deux méthodes, le protocole htsget et SAMtools, très largement employées dans le domaine pour consulter et analyser des fichiers volumineux de données génomiques.

  • Protocole htsget : accès aux données de variations et de lectures du séquençage dans le but de partager les données génomiques à grande échelle
  • SAMtools : interaction avec les données de séquençage haut débit

Dans la mesure où elles sont exécutés sur le service de conteneur Docker, elles s'intègrent parfaitement à Google Cloud Platform. Cet atelier se compose d'exercices pratiques avec les deux méthodes, qui vous apprendront à analyser vos propres séquences génomiques.

Join Qwiklabs to read the rest of this lab...and more!

  • Get temporary access to the Google Cloud Console.
  • Over 200 labs from beginner to advanced levels.
  • Bite-sized so you can learn at your own pace.
Join to Start This Lab
home
Accueil
school
Catalogue
menu
Plus
Plus