menu
arrow_back

Google Genomics: Qwik Start

アクセス可能時間: 30 分 · 完了までの時間: 30 分
Connection Details

無料

info_outline
You can take this lab for free! Other more advanced labs may cost credits to start.

GSP143

Google Cloud セルフペース ラボ

概要

Google Genomics は、世界のゲノム情報の体系化を進め、情報の利用しやすさの向上に取り組んでいる生命科学コミュニティを支援しています。ビッグデータと機械学習の発展に伴い、「ゲノム ビッグデータ」と呼ばれる新しい分野が確立されました。扱われる生物配列データは、ペタバイトからエクサバイトへと急速に拡大しており、これまで生物医学の分野では対処が困難とされてきた課題に活用されています。Google Genomics は、Google Cloud Platform で使用できる API であり、膨大なゲノム データセットの保管、処理、解析、共有を容易に行えるようにするものです。

このラボでは、Google Genomics を使用して、大量のゲノム データファイルの利用や解析によく使用される htsget プロトコルSAMtools の両メソッドを実装します。

  • htsget プロトコル: 大規模なゲノムデータを共有する際の配列読み込みデータおよび変異データへのアクセスに効果を発揮します。
  • SAMtools: 高いスループットで配列データの入出力を行います。

これらは、コンテナ サービスである Docker 上で動作するため、Google Cloud Platform で、細かいメッシュ上に構成されます。このラボでは、両方のメソッドを実際に体験し、対象となるゲノム配列を解析します。

Join Qwiklabs to read the rest of this lab...and more!

  • Get temporary access to the Google Cloud Console.
  • Over 200 labs from beginner to advanced levels.
  • Bite-sized so you can learn at your own pace.
Join to Start This Lab
home
ホーム
school
カタログ
menu
もっと見る
もっと見る