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Google Genomics: Qwik Start

Tempo de acesso: 30 minutos · Tempo para conclusão: 30 minutos
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Gratuito

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GSP143

Laboratórios de treinamento assíncrono do Google Cloud

Visão geral

A comunidade de ciências biológicas pode contar com o Google Genomics para organizar as informações genômicas do mundo todo e torná-las acessíveis e úteis. Os avanços nas áreas de Big Data e machine learning deram início a um novo campo de "Big Data de genomas". Petabytes dessas sequências biológicas (que estão crescendo rapidamente e chegando a exabytes) estão sendo usados para solucionar alguns dos problemas mais difíceis no campo biomédico. O Google Genomics é uma API que faz parte do Google Cloud Platform e permite armazenar, processar, explorar e compartilhar grandes conjuntos de dados genômicos com facilidade.

Neste laboratório, você usará o Google Genomics para implementar o htsget protocol e o SAMtools, ambos métodos populares na área para acessar e analisar arquivos grandes de dados genômicos.

  • htsget protocol: acessa dados de leitura e variação de sequenciamento para compartilhar dados genômicos em grande escala
  • SAMtools: interage com dados de sequenciamento de alta capacidade

Uma vez que eles são executados no Docker de serviço de contêiner, ele combina muito bem com o Google Cloud Platform. Neste laboratório, você terá experiência prática com os dois métodos, para poder analisar suas próprias sequências genômicas por conta própria.

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